Software ed Applicazioni

[alessio.alessi]

Disponibile su INDACO

- la versione 2020 UP4 dei compilatori INTEL
- la macchina virtuale per l'analisi dei dati comprendente i servizi
Rstudioserver
Mysql
MongoDB
Shiny

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Disponibile su INDACO la macchina virtuale contenente
- blobtoolkit2

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Accesso semplificato alle applicazioni
Sul desktop di ogni utente è disponibile il software
starter
per avviare le applicazioni interattive più frequenti.
Inoltre è disponibile il programma

status

per
conoscere lo stato del cluster centrale e le risorse libere.

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Gent. utenti di INDACO,

è disponible la nuova versione di
Cell Ranger 5.0 10X

https://support.10xgenomics.com/single- ... ell-ranger
Cell Ranger is a set of analysis pipelines that process Chromium single-cell RNA-seq output to align reads, generate feature-barcode matrices and perform clustering and gene expression analysis.

istruzioni nella guida utente

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Disponibile sul desktop degli utenti il software starter aggiornato per l'avvio di


Blender
Cluster Spark
Cluster python 2021
Comsol
Intel one api python 3.7.9 tensorflow
Jupiter
Matlab 2020b
Meshroom
R
Stata

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Segnaliamo l' aggiornamento della guida utente in PDF al link

https://www.indaco.unimi.it/index.php/guida-utente-pdf/

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Avvisiamo gli utenti che è stata
aggiornata

- la versione del software STATA alla 17
- la versione di Matlab alla 2021b

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Gli utenti che intendono avviare applicazioni interattive in modalità grafica possono utilizzare il programma STARTER che trovano sul Desktop.

Sarà possibile eseguire le seguenti applicazioni
-Matlab
-Blender
-Meshroom
-Stata
-Jupyter
-Comsol
-Rstudio

ed avviare un

-cluster python
-cluster Dask
-cluster Spark
in modalità guidata.